Отличительной чертой моделей микроскопов данной линейки (Levenhuk S) является наличие только одного осветителя – нижнего, что позволяет наблюдать в данный микроскоп исключительно прозрачные объекты в проходящем свете (например, биологические тонкие срезы, химические процессы или отдельные вещества). Роль осветителя выполняет небольшое двустороннее зеркало, с одной стороны оно плоское, с другой – вогнутое, что обеспечивает более интенсивное освещение, требуемое для изучения некоторых объектов.
К другим особенностям микроскопа Levenhuk 5S NG относится фокусировочный механизм: сверху расположена ручка грубой фокусировки, а ниже – микроподстройка.
Предметный столик оснащен стандартными зажимами, а также револьверной диафрагмой на шесть различных отверстий разного диаметра, чтобы пользователь мог регулировать интенсивность светового пучка. Окулярный тубус располагается под углом 90 градусов, однако конструкция микроскопа позволяет настраивать пользователю угол наклона под себя.
В комплекте также предусмотрен защитный чехол, в который можно помещать прибор в то время, когда он не используется.